Effector profile
| PlantPEAD ID: PlantPEAD01479 | Uniprot ID: A0A8S9ZYP8 | Source: Orthologous |
| Localization: Cytoplasmic(Pre) | Pathogen taxonomy ID: 189291 | Pathogen type: Nematoda |
| Species: Meloidogyne graminicola | Strain: VN-18 | Other name: |
| Gene name: | NCBI Gene ID: JABEBT010000009 | |
| Entry name: A0A8S9ZYP8_9BILA | Protein name: Ketosynthase family 3 (KS3) domain-containing protein | |
| DOI: | ||
Gene/Protein information
Gene sequence:
ATGTATTTTTCTGTTGAATTAAATGAAAAAATACCTAAAGGCAATTTTTGGTTAGAAGAAAATGGAGGAGAAATAATAATTAATGGAGAAGAATTAATATTTCAAATTTTAGATGAAAAAAATTTTGAAGAAATAAATGAAATAAAAATTAATAAATTAATTAATATAAAGAATAATGAATTGTCATCATTAATTATTAGTTCAATTGCTTGTCGATTACCTGAAAATATTAATTCACCTGAACAGTTTTGGACTCTACTCAAAGAAGGTTATTCAACTAATCAACGAATACCAGCAAATAGAATTATTGAAAGAAATTCATTAATTAGAGGGGATTTTAATGGTGGAAATATACCTGTTGAAGGAGGTCATTTTCTTAGCTTTGATTTGGCTAGTTTCGATCCCAATTTTTTTGGTTTATCAGCTTTGGAAGCCTCTGCACTTGATCCTCAACAACGTCTTTTACTTGAATGTACATGGGAATGTGTACAACAAGTTAATTTTAATTCAAAAAAAGAAATTGAAGAATGTGGAGTTTTTATTGGGTTTATGAGTAATGAATATTATGAATTAACTGACCAAAAAGGAAATGCTTTACAAATGCTTGGAACAGCAGCATCTGCATTCTCTGGAAGATTGGCACATTTTTTGGATTGCAAAGGACCAACACTTTCTATAGACACAGCTTGTTCTTCTTCTCTTGTAGCTTTACAATTAGCTGTTGAGGCAATAAAGACAGGAAAATGTCCAAGAGCAATAGTTGGAGGAATTAATTTAACTTTGACAGCTAAAGGATTGGCTCAACGTGCAAATGCTGGTATGCTTTCTGAAGATGGATGTTGTAGAGTTTTTGATTCTAATGCTAATGGTTATGGAAGAGGGGATGGTTGTGTTGTAATGATGATTGAGGGAATTTCTAATGATAAATTAGAATTATTACCTCATTGGGGAATAATTGAGTCAATTGAGTGTGGACATGATGGACATAGCTCTGCCTTAAATGCCCCTAATGGATTATCACAACAACAATTAATTATTAAATGTTTAGAAAACCTTAATACAGAAAAGAAACAATTGCTTAGCTGTTGGGAATGTCATGGGACAGGTACAGCACTTGGAGACCCTATTGAGTTTTTGGCATTGGCAAAAGCATTAAATAATTGTGGAGTTAAAGAGAAGTTATTAGTAGGAAGTGCAAAAGCAAATATTGGACATACTGAAGCAGCCTCTGGTCTTGTAGGTGTTATGAAGGCACTTCTTCAATTAAAATATGGAGAAATGCCTTCCTTACCTAATTTTAAACAAATTAATCCTGAAATTGTTCGAGGAATGGAAGCAAATGGTTGGGAAAATATTGAAAATAAATGGCCTATTCAAATAGCAACTGTTAATACAGAACTAAAATTAAAAGGAAAAAATAAAATTCAAAAATTACTTGCTGGTGTAAATTCGTTTGGTGTGTCTGGAACTCTTTGTTGTGCAATTATTTCATTAGACAGGTCAATTGAACCTAAACAAATATTTAAATTACATCAACAAATGGACAAATATAGTTCCCAAAAATGGCAACGTTTATTACCTTTACAAGCTAATTCAGAATATTCAATTAATAAAATTATAAAAAAATATTTAAATTTTGTAAAAAATCAAAATGAATGGAAAATTAATGAAATATGTGCTGCTTCAGTAAAATTAATTAATGATAATAATAATAATTTTAAAAATCCAACATTAAATGTTAAAGCAGTAATAATCTTTCCTGAAGAGAATAAAGAAGGGAAAGAACCTTTAATTATTAAAAAGAGTAATATAAATTCAATTTATTATTGCCTTGATTTTTGGCCTAAAATCGCTTGGAATTTATTTGACCAAGTTTTATCCTATCAACAAGCATTTAATTTAATTTTAAATAAACTTGGAATTAAAAATAAAAATATTAAAGAATTAGATTATTCAATAATTAAATTATCTGATACTTTTGGACGTTTTAAAATTTTAAAAGATTTTGGAATAATTAAAAAAGAAAATGAAATAATTAATAATAATAATTTAATAATAATTAATTTATTAAGAGAAATT
Protein sequence:
MYFSVELNEKIPKGNFWLEENGGEIIINGEELIFQILDEKNFEEINEIKINKLINIKNNELSSLIISSIACRLPENINSPEQFWTLLKEGYSTNQRIPANRIIERNSLIRGDFNGGNIPVEGGHFLSFDLASFDPNFFGLSALEASALDPQQRLLLECTWECVQQVNFNSKKEIEECGVFIGFMSNEYYELTDQKGNALQMLGTAASAFSGRLAHFLDCKGPTLSIDTACSSSLVALQLAVEAIKTGKCPRAIVGGINLTLTAKGLAQRANAGMLSEDGCCRVFDSNANGYGRGDGCVVMMIEGISNDKLELLPHWGIIESIECGHDGHSSALNAPNGLSQQQLIIKCLENLNTEKKQLLSCWECHGTGTALGDPIEFLALAKALNNCGVKEKLLVGSAKANIGHTEAASGLVGVMKALLQLKYGEMPSLPNFKQINPEIVRGMEANGWENIENKWPIQIATVNTELKLKGKNKIQKLLAGVNSFGVSGTLCCAIISLDRSIEPKQIFKLHQQMDKYSSQKWQRLLPLQANSEYSINKIIKKYLNFVKNQNEWKINEICAASVKLINDNNNNFKNPTLNVKAVIIFPEENKEGKEPLIIKKSNINSIYYCLDFWPKIAWNLFDQVLSYQQAFNLILNKLGIKNKNIKELDYSIIKLSDTFGRFKILKDFGIIKKENEIINNNNLIIINLLREI
Loading ...
Main properties of effector
| Molecular weight | Sequence length | Theoretical pI | GRAVY | Instability index |
|---|---|---|---|---|
| 77336.1 | 693 | 6.19 | -0.163 | 37.28 |
Plant infestation information
| Experimental plant: | |
| Susceptible plant: | Disease name: |
| Host classification: | NCBI Species: |
Pathogen-plant protein interaction
| Uniprot ID | Protein name | Gene name | Species | Protein sequence |
|---|
No Record found.
External Links
Interpro: IPR018201,IPR014031,IPR014030,IPR020841,IPR016039
Pfam: PF00109,PF02801
SMART: SM00825
KEGG:
PRINTS: