Effector profile
PlantPEAD ID: PlantPEAD39629 | Uniprot ID: A0A2N1N8P4 | Source: Orthologous |
Localization: Apoplastic(Pre) | Pathogen taxonomy ID: 588596 | Pathogen type: Fungi |
Species: Rhizophagus irregularis | Strain: C2 | Other name: Arbuscular mycorrhizal fungus, Glomus intraradices |
Gene name: | NCBI Gene ID: LLXL01000644 | |
Entry name: A0A2N1N8P4_9GLOM | Protein name: Extracellular metalloproteinase | |
DOI: |
Gene/Protein information
Gene sequence:
ATGAAACCAACGAAGACTATTACTTTAATAACATGGGCGTTGTTAGCCTTGGCAGCTAACGAAAGTAGAGCTCATGCTATTAATAATAAATTTACCTCTACTTCAAACATCTCAAGAAGTAAAGGAAATTTTGGACCGGAACTTGCTCATCGATCATATATAGTTCCAAATTCGTTACGTACCACGAACCCTTCCATTAACGCATTAACATCACCGAACGAAGAATTATCACCTCAAGAAATTGCTATCAAATTCGTTAAAGAAAGCCTTCATCCAGATGCTGATTTTAAAATTAAAAATATATATAAATCGGAACATAACGGAATTACTCATGTATATATTAAACAAATTTATAATGGATTAGAAGTTGTTAATGGTGACTTAAATGTCAACATTGACAAATATGGTAGAGTAATCTCTTATGGTGATAGTTTTGTTTTACCGCCATCACTTGGTCAAAATAAATGTTCCGATTTCTCTAATCAACCTGAGGAAGAGAATATTTTTATGAAAAATGGAAAATATTTTATCGCTTCTAATTCTCGTCAAGTTTATATTTCTACTCGTCCTTTAGATTTTTTAAACCAAGGAAAAAAGAATGTAAAAGGTAGCGATAATCATAATACAGTTAAATATAAGGTTAATGATTCAGGAAAAACTATATCACCATTTGAGGCATTAAACTCGTTTTCATCATACATTGATAAACAAGCTATTAAACCAGAAAATTTACAATATTATGAATCATTTGATGATCAAGGTTATTTAATGGTTGAAAATGTTCCTTTCGCTTTATCACCAGTTAAAATTTCACAAAATTATATTCAACTGGATGATATGTCATTGCAATTGGTTTGGGACTTACAAATTGAAATGGAAAACAATTGGTATCATGCACATATTAATGCTAATACAGGTGAATTAATTGCATTGATGGATTGGGTTGCGGATGCGACTTATAATGTATTCCCATTAGGTGTAAATGATCCTTTAGATGGTGGTCGGGAATTAGTTACTGATCCTAATGATGTTATTTCTTCACCTTATGGTTGGCACAATCAAGGGGAAAGAAATTTTACCAATACTATTGGTAATAATGTTTATGCTCAAGAAAATTTAAATGGAAGATGGGAATGGGAAAATAATTATAGACCTGAGGGTACTGAATTTTTAATATTTGATTTCCCATTGAATTTATCTGATCCACCCAAATCTTATATTGATGTTGCCGTAACCAATCTATTCTACTGGAATAACATGGTTCACGATTTGTTTTATAGATATGGTTTTAATGAAGTCGCTGGTAACTTTCAACAATATAACCATGGTAAAGGTGGTAAAGAAGGAGATCCAGTAATTGCAAACGCACAAGATGGATCCGGATTTAATAATGCTAACTTTGCCACACCTCCGGATGGTCAACACGGTAAGATGCGCATGTACGTTTGGGACATATCAAATCCATGGAGGGATGGTGATTTAGAATCAGGAATTATTATCCATGAATATTCCCATGGAATTTCCACTCGATTGACAGGAGGACCAGCTAATAGTGGATGTTTAGGATGGGGAGAAGCAGGTGGTATGGGAGAGGGATGGGGAGATTTCTTTGCTACCATTTTACGTATGAAACCCGAATTTAATAGTACTAAAGATTTTGGTATGGGTAATTGGGCTAATGGCGATAATGGAATAAGAAAATATCCTTATTCTACTTCGAAGGTAACCAATCCTGAAACATATAAATATGTAGATAAACCTGAGTATTGGGGTGTACATGCTAAAGGAGAGGTTTGGGCAGAAATATTGTATGAAGTATATTGGAACTTGGTAGAAAAACATGGTTTTACATTAGAATGGTTCCCTCCTACGGTAGATCATGATTCATATAAATGGTATACAACCAAAACATCACCTGATGGCCTTGATACGCTTAAATATCCAAAACATGGTAATACAGTAGCATTACAATTGGTCGTTGATGGTATGAAATTACAACCATGCCGTCCATCATTTATTGATGCGCGTGATGCAATAATTCAATCCGATGAAATTTTAACCAATGGTGAAAACAAATGTGAACTTTGGAAAGGTTTTGCAAAACGTGGTCTTGGTATTAAAGCTAAAATTATTGGTTCAAATCCTTGGGGTGGACTTCATGAAGAAGATTTCCATGTTCCTGTAGATTGTGAAAATAGTCCTGATGATGAAATTTAA
Protein sequence:
MKPTKTITLITWALLALAANESRAHAINNKFTSTSNISRSKGNFGPELAHRSYIVPNSLRTTNPSINALTSPNEELSPQEIAIKFVKESLHPDADFKIKNIYKSEHNGITHVYIKQIYNGLEVVNGDLNVNIDKYGRVISYGDSFVLPPSLGQNKCSDFSNQPEEENIFMKNGKYFIASNSRQVYISTRPLDFLNQGKKNVKGSDNHNTVKYKVNDSGKTISPFEALNSFSSYIDKQAIKPENLQYYESFDDQGYLMVENVPFALSPVKISQNYIQLDDMSLQLVWDLQIEMENNWYHAHINANTGELIALMDWVADATYNVFPLGVNDPLDGGRELVTDPNDVISSPYGWHNQGERNFTNTIGNNVYAQENLNGRWEWENNYRPEGTEFLIFDFPLNLSDPPKSYIDVAVTNLFYWNNMVHDLFYRYGFNEVAGNFQQYNHGKGGKEGDPVIANAQDGSGFNNANFATPPDGQHGKMRMYVWDISNPWRDGDLESGIIIHEYSHGISTRLTGGPANSGCLGWGEAGGMGEGWGDFFATILRMKPEFNSTKDFGMGNWANGDNGIRKYPYSTSKVTNPETYKYVDKPEYWGVHAKGEVWAEILYEVYWNLVEKHGFTLEWFPPTVDHDSYKWYTTKTSPDGLDTLKYPKHGNTVALQLVVDGMKLQPCRPSFIDARDAIIQSDEILTNGENKCELWKGFAKRGLGIKAKIIGSNPWGGLHEEDFHVPVDCENSPDDEI
Loading ...
Main properties of effector
Molecular weight | Sequence length | Theoretical pI | GRAVY | Instability index |
---|---|---|---|---|
82319.7 | 738 | 5.17 | -0.579 | 30.57 |
Plant infestation information
Experimental plant: | |
Susceptible plant: | Disease name: |
Host classification: | NCBI Species: |
Pathogen-plant protein interaction
Uniprot ID | Protein name | Gene name | Species | Protein sequence |
---|
No Record found.
External Links
Interpro: IPR011096,IPR001842,IPR027268
Pfam: PF07504,PF02128
SMART:
KEGG:
PRINTS: